- Başlık: Cancer Biomarkers Using Integrative Single Cell and Bulk Sequencing
- Sunucu: Akdeş Sevim Harmancı
- Tarih: 23 Ekim, 2018
- Dil: İngilizce
- Özet: Kanser genomik ve epigenomik değişikliklerin bir hastalığıdır. Tek nükleotid değişiklikleri, kopya sayısı varyasyonları (CNV), kromozomal yeniden düzenlemeler ve DNA metilasyonundaki modifikasyonlar birlikte bir tümör oluşumunu tetikler. Kanser araştırmalarındaki bütünleştirici ‘omik’ yaklaşımlar, tümör biyolojisinin daha derin anlaşılmasına yol açtı ve kişiselleştirilmiş tıbbın uzun vadeli hedeflerini desteklemek için gerekli temeli oluşturuyor. Bu konuşmada, bütünleştirici toplu veya tek hücreli sıralama verilerini kullanarak beyin tümörü biyobelirteçlerinin tanımlanmasından bahsedeceğim. Bu konuşma iki bölümden oluşacaktır. İlk bölüm, genetik ve epigenetik verilerin karmaşık bütünleştirici analizi yoluyla NF2 olmayan menenjiyomları karakterize ettiğimiz çalışmamızı kapsayacaktır. Ayrıca atipik menenjiyom ve malign glioma dönüşümüne yol açan epigenetik ve genetik mekanizmaları da açıklayacağım. İkinci bölümde, tek hücreli ve toplu RNA Sıralama verilerini kullanarak CNV olaylarını çok ölçekli çözünürlükte görselleştiren ve entegre eden CaSpER adlı algoritmamız tanıtılacaktır.
- Bigmarker: https://www.bigmarker.com/bioinfonet/AkdesSerinHarmanci
- Youtube: https://www.youtube.com/watch?v=FSL3KT8gY2s