Sunucu
Seyit Kale
Seyit Kale, 2006 yılında İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi Fizik Bölümü’nden lisans derecesini, 2012 yılında Brandeis Üniversitesi Biyofizik ve Yapısal Biyoloji Bölümü’nden doktora derecesini almıştır. Doktora sonrası çalışmalarına Chicago Üniversitesi’nde devam etti ve hesaplamalı kimya için yöntemler geliştirdi. Daha sonra 2015 yılında Bethesda, Maryland’deki Ulusal Sağlık Enstitüleri’nde misafir araştırmacı oldu ve burada kromatin ve epigenetik fiziğine olan ilgisini geliştirdi ve sürdürdü. İzmir Biyotıp ve Genom Merkezi’ne 2019 yılının sonlarında araştırma grubu lideri olarak katıldı ve şu anda hesaplamalı biyofizik alanında bir laboratuvar yürütmektedir.
Özet
Biyolojideki yapısal çalışmalar, hücrelerimizin içindeki moleküler makinelerin nasıl göründüğüne dair paha biçilmez içgörüler sağlar, ancak hikayeler genellikle bitmekten uzaktır. Bir makromolekülün atomik koordinatları kümesi bir resim gibidir: bin kelimeye bedeldir. Yine de bir resim, molekülün dinamik kişiliğinin altında yatan zamansal bilgiden yoksundur. Son birkaç on yılda, bilgi işlem gücündeki üstel büyüme, giderek daha fazla fizik bilimcisini yaşam bilimleriyle ilgili sorulara yöneltti. Newton hareket denklemlerini biyolojik olgularla ilişkilendirilebilir uzunluk ve zaman ölçeklerinde yaymak için daha hızlı algoritmalar ve daha doğru etkileşim potansiyelleri geliştirilmiştir. Bu konuşmada, sıklıkla hoş karşılanmayan bir analojiyi, yani bir moleküler simülasyonun nasıl bir in silico deney olarak düşünülebileceğini, tarihsel ve fiziksel bir perspektif sunarak tartışacağım.
Tarih: 5 Mart, 2020 – 5:00 pm (GMT+3)
Dil: İngilizce
Webinara buradan kayıt olabilirsiniz:
https://www.bigmarker.com/bioinfonet/Molecular-Simulations-as-an-in-silico-Experiment