Sunucu
Aylin Bircan
Aylin Bircan 2012 yılında Koç Üniversitesi Kimya Bölümü’nden mezun oldu. Çeşitli ilaç firmalarının Kalite Kontrol ve Güvence departmanlarında çalıştı. 2018 yılında Kadir Has Üniversitesi’nden Hesaplamalı Biyoloji ve Biyoinformatik alanında yüksek lisans derecemi aldı. 2018 Eylül ayından beri Sabancı Üniversitesi Moleküler Biyoloji, Genetik ve Biyomühendislik programında doktora öğrencisidir. Dr. Ogün Adebali danışmanlığında Sınıf C GPCR’lerin filogenetik analizi üzerine çalışmaktadır.
Özet
Şiddetli akut solunum sendromu koronavirüs 2 (SARS-CoV-2), Wuhan’da ortaya çıkmış ve kıtalara yayılarak COVID-19 pandemisine neden olmuştur. Bu konuşmada, Türkiye’deki virüs izolatlarının kapsamlı genomik analizine odaklanan son çalışmamızdan bahsedeceğim. Küresel olarak elde edilen 15.277 şiddetli SARS-CoV-2 genomu ile bir filogenetik ağaç oluşturduk ve virüs izolatlarını filogenetik ağaca ve daha önce açıklanmış sınıflandırma yöntemlerine göre kümeledik. Türkiye’de izole edilen ve sekanslanan ilk otuz SARS-CoV-2 genomunun filogenetik analizini gerçekleştirerek ülkede dolaşan spesifik grupları belirledik. Sonuçlarımız, virüsün ülkeye ilk girişinin bildirilen ilk enfeksiyon vakasından daha erken olduğunu göstermektedir. Türkiye’den izole edilen virüs genomları filogenetik ağaçtaki çoğu tip arasında dağılmıştır. On yedi alt kümeden ikisi, muhtemelen ülkede geniş bir şekilde yayılmış olan Türkiye izolatları ile zenginleştirilmiş olarak bulunmuştur. Son olarak, virüs genomlarını filogenetik yerleşimlerine göre izledik. Bu analiz, virüsün birden fazla bağımsız uluslararası girişini önerdi ve iç iletim için bir merkez ortaya koydu.
Tarih: 17 Haziran, 2020 – 2:00 pm (GMT+3)
Dil: İngilizce
Webinara buradan kayıt olabilirsiniz:
https://www.bigmarker.com/bioinfonet/Phylogenetic-Analysis-of-SARS-CoV-2-Genomes-in-Turkey