Farklı hesaplama yaklaşımları kullanılarak RNA ve Protein-RNA komplekslerinin modellenmesi

Dr. Elisa Frezza

2010 yılında Padova Üniversitesi (İtalya) Malzeme Bilimi alanında yüksek lisans derecesi aldıktan sonra, Elisa Frezza çalışmalarına Padova Üniversitesi Kimya Bilimleri Bölümü’nde Prof. Ferrarini’nin danışmanlığında doktora yaparak devam etti. Doktora araştırması, çift sarmallı nükleik asit oligomerleri tarafından oluşturulan sıvı kristal fazların özellikleri gibi yumuşak madde problemlerini fiziksel ve teorik kimya perspektifinden ele alıyordu. Doktora sonrası araştırma döneminde, İnsan Beyni Projesi kapsamında Dr. Lavery’nin denetiminde MMSB CNRS UMR 5086/Université Claude Bernard Lyon 1 laboratuvarında biyofizik, biyoinformatik ve yapısal biyoloji konularında çalıştı. Eylül 2017’den bu yana Elisa Frezza, CiTCoM laboratuvarı bünyesinde Université Paris Cité Eczacılık Fakültesi’nde Yardımcı Doçent olarak görev yapmaktadır. Araştırma faaliyetleri, geniş bir bilimsel topluluğu ilgilendiren malzeme biliminden biyolojiye kadar uzanan problemleri teorik ve hesaplamalı yöntemlerle ele almaktadır. Tüm atom ve kaba taneli moleküler dinamik simülasyonları, iç koordinatlardaki normal mod analizi ve biyostatistik gibi çeşitli yöntemler geliştirmiş ve uygulamıştır. Elisa Frezza, farklı metodolojiler gerektiren karmaşık projeler üzerinde çalışmakta ve deneyselciler ile teorisyenlerden oluşan birçok ekiple iş birliği yapmaktadır. Araştırmaları, fizik, kimya, biyoloji ve bilgisayar bilimi kesişiminde yer alan disiplinlerarası bir niteliğe sahiptir ve moleküler düzeyden mezo ve makro ölçeklere kadar farklı ölçekleri kapsamaktadır. Son dönemdeki ana araştırma ilgi alanları, özellikle protein-protein ve protein-RNA etkileşimlerini modellemek, RNA moleküllerinin dinamiklerini ve reaktivitesini incelemek, deneysel verileri entegre etmek ve biyomakromoleküllerdeki büyük konformasyonel değişiklikleri incelemek için iç koordinatlardaki normal mod analizini geliştirmeyi içermektedir.