Sunucu

Özet

Çeşitli ökaryotların mitokondrileri standart genetik koddan çeşitli sapmalar geliştirmiştir, ancak olası modifikasyonların genişliği ve filogenetik dağılımı sadece eksik olarak bilinmektedir. Ayrıca, daha önce dizilenmiş mitojenomlardaki bazı kodon yeniden atamalarının gözden kaçmış olması ve bunun da veri tabanlarında yanlış protein dizilimleri ile sonuçlanması mümkündür. Mitojenom tarafından kodlanan proteinlerdeki korunmuş amino asit pozisyonlarındaki kodonların dağılımı göz önüne alındığında, Sphaeropleales yeşil alg takımının mitokondrileri, daha önce gözden kaçanlar ve şimdiye kadar incelenen herhangi bir çeviri sisteminde benzeri görülmemiş olanlar da dahil olmak üzere, mevcut çeviri tablolarının yeniden tanımlanmasını ve en az yedi yeni tablo oluşturulmasını gerektiren çeşitli kodon yeniden atamaları sergilemektedir. Hydrodictyaceae’de alanini kodladığına şüphe olmayan UAG kodonunun anlamına ilişkin önceki bir tartışmayı çözüyoruz. Ayrıca AGG’nin, bazen AGA ile birlikte, çeşitli sphaeroplealeanlarda arjinin yerine alanini kodladığını gösteriyoruz. Yeni tespit edilen diğer değişiklikler arasında AGG kodonunun Arg’den-Met’e ve belirli türlerde CGG kodonunun Arg’den-Leu’ya yeniden atanması yer almaktadır. Sphaeroplealean mitojenomları tarafından belirlenen tRNA’ların analizi, önerilen yeniden atamalar için doğrudan destek ve moleküler dayanak sağlar. Ayrıca, mitokondriyal salım faktörü mtRF1a’da, Sphaeropleales’te sonlandırma kodonlarının kullanımındaki değişikliklerle ilişkili olan, iki bağımsız duraktan duyuya UAG ataması, bazı Scenedesmaceae’de UGA’nın yeniden getirilmesi ve grupta yaygın olan UCA’nın duyudan durağa yeniden atanması dahil olmak üzere benzersiz mutasyonlara işaret ediyoruz. Kodon kaybolması, Sphaeropleales’te mitokondriyal genetik kodun dinamik evriminin ana itici gücü gibi görünmektedir.

Tarih: 28 Nisan, 2020 – 7:00 pm (GMT+3)

Dil: İngilizce

Webinara buradan kayıt olabilirsiniz:
https://www.bigmarker.com/bioinfonet/Evolution-and-Unprecedented-Variants-of-the-Mitochondrial-Genetic-Code-in-a-Lineage-of-Green-Algae